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एनआईआर क्षेत्र (750 ~ 2500 एनएम) में उनके अवशोषण के कारण एनआईआर फ्लोरोसेंट रंगों का व्यापक रूप से रात्रि दृष्टि, अदृश्य सामग्री, लेजर प्रिंटिंग, सौर कोशिकाओं और अन्य क्षेत्रों में उपयोग किया जाता है।
जब जैविक इमेजिंग में उपयोग किया जाता है, तो इसमें निकट-अवरक्त अवशोषण/उत्सर्जन तरंग दैर्ध्य, उत्कृष्ट जल घुलनशीलता, कम बायोटॉक्सिसिटी, विशिष्ट ऊतक या कोशिका लक्ष्यीकरण और अच्छी कोशिका प्रवेश आदि होता है।
विशिष्ट प्रकार सायनिन डाईज़, बॉडीपी, रोडामाइन, क्वार्बोक्सिल और पोर्फिरिन हैं।